Проектная пропускная способность аэровокзала 600 пасс/час и 100 пасс/час в международном секторе.

Аэровокзал аэропорта Якутск имеет:

1. Сектор российских авиалиний, оборудованный двумя зонами досмотра и 7 (семью) стойками регистрации.
2. Сектор международных авиалиний, оборудованный одной зоной досмотра и 3 (тремя) стойками регистрации.
3. Сектор местных авиалиний, оборудованный одной зоной досмотра и 2 (двумя) стойками регистрации.

Служба спецтранспорта имеет в наличии:

1. Автопарк для разгрузки/загрузки багажа, почты и грузов в количестве 9 бортовых автомашин и 3-х бортовых автомашин КРАЗ.
2. 3 автобуса для доставки пассажиров к (от) ВС + 1 резервный.
3. 4 автотрапа для посадки для посадки/высадки пассажиров.
4. 10 автомашин УМП – 350 для подогрева ВС в зимнее время.

Пропускная способность пограничных и таможенных зон регламентируется и устанавливается в соответствии с нормативно-правовыми актами соответствующих федеральных служб (пограничной, таможенной).
Исходя из вышеперечисленных возможностей, часовая пропускная способность служб аэропорта Якутск устанавливается:

Регистрация пассажиров на местных линиях начинается за 2 часа и заканчивается за 40 минут до вылета.
На центральных и международных линиях начинается за 3 часа и заканчивается за 40 минут до вылета.